Inokulaatio (lat. inoculatio) ( <in- lat. sisään + oculus lat. silmä, pistokas) on mikrobien ja antigeenimateriaalin siirtoa elimistöön tai viljelyalustaan. Näytteitä kasvatetaan hetken aikaa inkubaattorissa, joka on bakteeriviljelykaappi. Viljelysalustaan (yleensä petrimalja) voidaan näytteestä riippuen lisätä elatusainetta, esimerkiksi agaria. Inokulaatio on myös esim. influenssaviruksen rokottamista elimistöön flunssan ehkäisemiseksi[1] [2].
Inokulaatilla tarkoitetaan inokuloitua ainetta.