PTS-DOS on venäläisen PhysTechSoftin kehittämä MS-DOS-yhteensopiva käyttöjärjestelmä. Nykyisin omaa versiotaan PTS-DOS:sta kehittää myös joidenkin entisten PhysTechSoftin ohjelmoijien perustama saksalainen Paragon GmbH.
PTS-DOSista on olemassa ainakin versiot Paragon DOS Pro 2000 ja PTS-DOS 2000. PhysTechSoft jatkoi PTS-DOS:n kehittämistä ja julkaisi lopulta version PTS-DOS 32:n, joka on 32-bittinen DOS.