GeneCards

GeneCards
Portal baze podataka GeneCards
Vrsta	Baza genomskih podataka vrste Homo sapiens
Status	Aktivna
Glavno sjedište	Krunski centar krunskog ljudskog genoma, Weizmannov institut za nauku, Izrael
Jezik	Engleski
Br. volontera	Neograničen
Veb-sajt	www.genecards.org HTLM

GeneCards je baza podataka ljudskih gena koja pruža genomske, proteomske, transkriptomske, genetičke i funkcionalalne informacije o svim poznatim i predviđenim ljudskim genima.^[1][2][3][4] Razvija ga i održava „Krunski centar za genetiku čovjeka" (Crown Human Genome Center) na Weizmannovom institutu za nauku (Weizmann Institute of Science).

Cilj baze podataka je pružiti brz pregled ažuriranih dostupnih biomedicinskih informacija o pretraživanom genu, uključujući ljudske gene, kodirane proteine i relevantne bolesti.^[5][6] Baza podataka GeneCards omogućava pristup besplatnim resursima svjetske mreže o više od 7.000 svih poznatih ljudskih gena koji su integrirani iz > 90 izvora podataka, kao što je HUGO komitet za nomenklaturu gena (HGNC), Ensembl i NCBI. Glavna lista gena temelji se na odobrenim genskim simbolima koje je objavio HUGO. Podaci se pažljivo prikupljaju i odabiru iz ovih baza podataka pod njihovim motorom. Ako pretraga ne vrati nikakve rezultate, ova baza podataka dat će nekoliko prijedloga koji će korisnicima pomoći da izvrše pretraživanje, ovisno o vrsti upita i ponudit će izravne veze do pretraživača drugih baza podataka.

Vremenom je baza podataka GeneCards razvila niz alata (GeneDecks, GeneLoc, GeneALaCart) koji imaju specijalizovanije mogućnosti. Od 1998., baza podataka GeneCards široko se koristi u zajednicama iz oblasti bioinformatike, genomike i medicine, više od 15 godina.

1. ^ Rebhan M, Chalifa-Caspi V, Prilusky J, Lancet D (april 1997). "GeneCards: integrating information about genes, proteins and diseases". Trends in Genetics. 13 (4): 163. doi:10.1016/S0168-9525(97)01103-7. PMID 9097728.
2. ^ Rebhan M, Chalifa-Caspi V, Prilusky J, Lancet D (1998). "GeneCards: a novel functional genomics compendium with automated data mining and query reformulation support". Bioinformatics. 14 (8): 656–64. doi:10.1093/bioinformatics/14.8.656. PMID 9789091.
3. ^ Safran M, Solomon I, Shmueli O, Lapidot M, Shen-Orr S, Adato A, et al. (novembar 2002). "GeneCards 2002: towards a complete, object-oriented, human gene compendium". Bioinformatics. 18 (11): 1542–3. doi:10.1093/bioinformatics/18.11.1542. PMID 12424129.
4. ^ Harel A, Inger A, Stelzer G, Strichman-Almashanu L, Dalah I, Safran M, Lancet D (oktobar 2009). "GIFtS: annotation landscape analysis with GeneCards". BMC Bioinformatics. 10 (1): 348. doi:10.1186/1471-2105-10-348. PMC 2774327. PMID 19852797.
5. ^ "GeneCards". GeneCards. Arhivirano s originala, 14. 10. 2013. Pristupljeno 18 Oct 2013.
6. ^ "GeneCards". Arhivirano s originala, 17. 8. 2018. Pristupljeno 19 Oct 2013.