5-hydroxymethylcytosin

5-hydroxymethylcytosin
Strukturní vzorec
Strukturní vzorec
Model molekuly
Model molekuly
Obecné
Systematický název4-amino-5-(hydroxymethyl)pyrimidin-2(1H)-on
Sumární vzorecC5H7N3O2
Vzhledbílé krystaly[1]
Identifikace
Registrační číslo CAS1123-95-1
PubChem70751
ChEBI76792
SMILESC1=NC(=O)NC(=C1CO)N
InChIInChI=1S/C5H7N3O2/c6-4-3(2-9)1-7-5(10)8-4/h1,9H,2H2,(H3,6,7,8,10
Vlastnosti
Molární hmotnost141,13 g/mol
Není-li uvedeno jinak, jsou použity
jednotky SI a STP (25 °C, 100 kPa).

Některá data mohou pocházet z datové položky.

5-Hydroxymethylcytosin (5hmC) je pyrimidinová bázeDNA odvozená od cytosinu. Má význam v epigenetice, protože hydroxymethylová skupina na cytosinu může gen vypínat nebo zapínat. Poprvé byla tato sloučenina pozorována v roce 1952 u bakteriofágů.[2][3] V roce 2009 byl 5-hydroxymethylcytosin nalezen také v lidských a myších mozcích[4] a embryonálních kmenových buňkách.[5]

U savců se vytváří oxidací 5-methylcytosinu, kterou řídí TET enzymy.[6]

  1. https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/15337
  2. R. A. Warren. Modified bases in bacteriophage DNAs. Annual Review of Microbiology. 1980, s. 137–158. DOI 10.1146/annurev.mi.34.100180.001033. 
  3. G. R. Wyatt; S. S. Cohen. A new pyrimidine base from bacteriophage nucleic acids. Nature. 1952, s. 1072–1073. DOI 10.1038/1701072a0. PMID 13013321. Bibcode 1952Natur.170.1072W. 
  4. S. Kriaucionis; N. Heintz. The nuclear DNA base 5-hydroxymethylcytosine is present in Purkinje neurons and the brain. Science. 2009, s. 929–930. DOI 10.1126/science.1169786. PMID 19372393. Bibcode 2009Sci...324..929K. 
  5. M. Tahiliani, et al. Conversion of 5-methylcytosine to 5-hydroxymethylcytosine in mammalian DNA by MLL partner TET1. Science. 2009, s. 930–935. Dostupné online. DOI 10.1126/science.1170116. PMID 19372391. Bibcode 2009Sci...324..930T. 
  6. 5-Hydroxymethylcytosine. www.nextbio.com [online]. [cit. 2024-03-18]. Dostupné v archivu pořízeném z originálu dne 2017-09-04. 

From Wikipedia, the free encyclopedia · View on Wikipedia

Developed by razib.in