Hammer Bakker er en bakkeø i det sydlige Vendsyssel, nordøst for Nørresundby. Hammer Bakker ligger i Aalborg Kommune, Region Nordjylland. Området dækker delvist 4 sogne: Hammer Sogn, Horsens Sogn, Vodskov Sogn og Sulsted Sogn, alle beliggende i Kjær Herred.
Der fandt en betydelig skovrejsning sted i store dele af området i løbet af 1800-tallet, så bakkerne i dag er lyng- og skovklædte og er et yndet rekreativt område for bl.a. Aalborgs indbyggere. En stor del af Hammer Bakkers træer er gran og andre nåletræer, men der er en tendens i de senere år til, at større og større arealer skifter fra nåle- til løvtræer.
Hovedkraften bag Hammer Bakkers tilplantning var især sagfører Anders Olesen (1854-1929), som boede i sin villa, Møgelbjerg, på det, der i dag hedder Bodil Hjortsvej i Vodskov.
Hammer Bakker er omkranset af 4 mindre byer, Grindsted, Uggerhalne, Vodskov og Vestbjerg foruden de to meget små landsbyer Hostrup og Kinderup. Der ligger 3 kirker i tilknytning til bakkerne, Hammer Kirke, Vodskov Kirke og Sulsted Kirke.
I den sydlige del af området, ned mod Vodskov by, findes en række skoler og uddannelsesinstitutioner samt en del værksteder og andre institutioner for især handicappede. Det er på det område, som engang rummede Åndssvageforsorgens store centralinstitution, og som gradvist har været under afvikling siden særforsorgens udlægning i 1980.