Baptisten in Indonesien gibt es nachweislich seit Mitte des 20. Jahrhunderts. Zwar hatten englische Missionare bereits Anfang des 19. Jahrhunderts den Versuch unternommen, auf dem Gebiet des heutigen Indonesiens baptistische Gemeinden gründen, sie blieben aber erfolglos.
Drei der insgesamt sechs indonesischen Baptistenunionen gehören dem Baptistischen Weltbund an.[1] Diese sind:
Nicht zum Weltbund gehören folgende indonesische Gemeindebünde:
Neben den genannten Baptistenbünden, die zwischen 1981 und 2009 zu einer nationalen Arbeitsgemeinschaft, der Persekutuan Baptis Indonesia, zusammengeschlossen haben, existieren auch unabhängige Baptistengemeinden, über deren Mitgliederzahlen es keine genauen Angaben gibt.