Eine Hauptarmee (jap. 総軍, sōgun) war in der Organisationsstruktur des Kaiserlich Japanischen Heeres der größte, für einen bestimmten Kriegsschauplatz zuständige, Truppenverband. Sie setzte sich aus mehreren Regionalarmeen, Armeen und Divisionen zusammen. Zu Beginn des Pazifikkrieges gab es eine Hauptarmee, am Ende des Krieges waren es sechs. Hauptarmeen entsprachen einer Heeresgruppe oder der alliierten army group.
Die Hauptarmeen unterstanden dem Generalstab.
Kommandiert wurde eine Hauptarmee von einem Feldmarschall (gensui) oder General (taishō). Die Kommandeure der Hauptarmeen wurden am Kaiserhof in Anwesenheit des Tennō, des japanischen Kaisers, in einer eigenen Zeremonie zu Hauptarmeekommandeuren ernannt.