Als innere Organe werden im weiteren Sinn alle Organe mit Ausnahme des Bewegungsapparates und des Grenzorgans Haut bezeichnet. Im engeren und allgemein gebräuchlichen Sinn versteht man darunter die in der Brust- und Bauchhöhle liegenden Organe. Alle diese Organe sind funktionell Teile eines oder mehrerer Organsysteme.
Sie umfassen somit:
| Organe | Wissenschaft |
| des Herz-Kreislauf-Systems (Herz und Blutgefäße) | Kardiologie und Angiologie |
| des Blut- und Abwehrsystems | Hämatologie, Immunologie und Allergologie |
| des endokrinen Systems (Hormondrüsen und Hormonzellen) | Endokrinologie |
| des Atemtrakts | Pulmologie, Hals-Nasen-Ohren-Heilkunde |
| des Verdauungssystems | Gastroenterologie, Hepatologie |
| des Urogenitalsystems (Harn- und Geschlechtsorgane) | Urologie, Andrologie und Gynäkologie |