El estado brasileño de Santa Catarina se organiza adminstrativamente a nivel local en 295 municipios (se crearon otros dos municipios aunque no han sido implantados). El gobierno de cada municipio es responsable de tratar con los deberes locales. La administración del municipio está dirigida por un prefecto (prefeito), un Ayuntamiento (Câmara de Vereadores) y un Fórum Municipal.
El municipio más grande del estado es Lages, que comprende un área de 2644,313 km²,[1] mientras que más pequeño es Bombinhas, que tiene solo 36,6 km²; el más poblado es Joinville con 492 101 habitantes y el menos es Santiago do Sul con 1450 habitantes.
La primera subdivisión creada en la entonces Capitanía de Santa Catarina fue Nossa Senhora da Graça del río São Francisco do Sul, actual São Francisco do Sul, en 1660. El litoral catarinense fue seccionado administrativamente en tres "núcleos" litoraleños: São Francisco do Sul (al norte), Laguna (al sur) y Florianópolis (en el centro). La región serrana pertenecía a São Paulo (el estado de Paraná fue creado en 1853). En el reinado de Pedro I de Brasil, Lages (región planaltina ahora catarinense) fue incorporado al territorio catarinense. El extremo oeste fue definitivamente anexado al territorio catarinense después de la Guerra del Contestado. Desde entonces, se crearon varios municipios a partir de desmembramientos sucesivos de las primeras ciudades de Santa Catarina, en especial en 1930, 1944 y 1954.[2] El efecto de esta división territorial puede ser seguida en la tabla.