Ensembl

Ensembl
Tipo Base de datos biológicos y en línea del Proyecto Ensembl
Sede central Instituto Europeo de Bioinformática (EBI)
Sitio web https://www.ensembl.org
Yates, et al. (2020)[1]

Ensembl es un proyecto de investigación bioinformática que trata de "desarrollar un sistema de software que produzca y mantenga anotaciones automáticas en los genomas eucariotas seleccionados". Funciona como una colaboración entre el Wellcome Trust Sanger Institute y el Instituto Europeo de Bioinformática, una división del Laboratorio Europeo de Biología Molecular. Toda la información y software generados en el proyecto es de libre uso y acceso.[2][3]

La mayoría del software producido y utilizado se escribe en el lenguaje de programación Perl, y se basa en las librerías BioPerl. La Application programming interface de Perl puede utilizarse fácilmente en otros proyectos genómicos, por ejemplo en la anotación de genes o listas de clones. También hay disponible una API para Java.

  1. Yates A. D. (January 2020). «Ensembl 2020». Nucleic Acids Res. 48 (D1): D682-D688. PMC 7145704. PMID 31691826. doi:10.1093/nar/gkz966. 
  2. «Ensembl 2011». Nucleic Acids Research (en inglés). Consultado el 2 de mayo de 2021. 
  3. Flicek, Paul; Aken, Bronwen L.; Ballester, Benoit; Beal, Kathryn; Bragin, Eugene; Brent, Simon; Chen, Yuan; Clapham, Peter et al. (2010-1). «Ensembl’s 10th year». Nucleic Acids Research 38 (Database issue): D557-D562. ISSN 0305-1048. PMC 2808936. PMID 19906699. doi:10.1093/nar/gkp972. Consultado el 25 de junio de 2021. 

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