Aivorunko (lat. truncus encephali) on keskushermoston osa, johon kuuluvat ydinjatke, aivosilta ja keskiaivot[1], mutta joskus myös väliaivot luetaan kuuluvaksi aivorunkoon.[2] Aivorungon tehtävä on yhdistää aivot selkäytimeen[1] ja aivosilta yhdistää pikkuaivot iso- ja keskiaivoihin. Koko aivorungon läpi ulottuvaa hermosolujen verkostoa kutsutaan aivoverkostoksi, joka huolehtii ihmisen heräämisestä unen jälkeen aktivoimalla aivokuorta. Lisäksi aivoverkostosta lähtee ekstrapyramidaalisia ratoja, jotka huolehtivat muun muassa tasapainon ja lihastonuksen säilyttämisestä. Aivorunko on myös kymmenen aivohermon lähtöpaikka.