Une lagune est une étendue d'eaux côtières généralement peu profonde séparée de la mer par un cordon littoral (tombolo, lido...) de largeur variable. Ce cordon se modifie naturellement, et lorsqu'il est fin, il peut être vulnérable aux assauts de la mer (tempêtes, tsunamis) et à diverses formes d'artificialisation. Dans le Sud de la France les lagunes sont parfois appelées étangs en raison de la traduction littérale des termes occitans estanh ou estang. Ils sont également appelés barachois en acadien[1].
D'un point de vue scientifique, les lagunes constituent un modèle d'écosystème paralique. Lorsque l'étendue d'eau est séparée de la mer par un récif plutôt que par un cordon littoral, on parle de lagon en français (dans les pays anglophones les deux termes sont confondus sous la dénomination « lagoon »). La lagune Ebrié en Côte d'Ivoire ou la lagune de Venise sont des exemples de lagunes connues tandis que la Mar Menor, en Espagne, est la plus grande lagune d'Europe. En France la lagune de Thau, l'étang de Berre, l'étang de Bolmon, l'étang de l'Or, l'étang de Biguglia ou les marais endigués du golfe du Morbihan sont parmi les lagunes les plus connues.