La « migration verticale » est le nom donné au déplacement quotidien de certains organismes marins qui se déplacent chaque jour et chaque nuit, alternativement entre la surface et les profondeurs. Cette migration est sous le contrôle des variations d'intensité lumineuse et/ou (pour certaines espèces) de la polarisation de la lumière subaquatique perçues par les espèces concernées[1]. La migration verticale peut donc être troublée par la pollution lumineuse.
Dans le cas où les organismes migrent vers la surface pendant la nuit pour s'alimenter et descendent dans les couches plus profonde, le jour, cette migration est aussi qualifiée de nycthémérale. Certains auteurs ont comparé ces mouvements à une sorte de battement ou de pompe biologique[2].
Chez certaines espèces, seule une partie de la population effectue cette migration, l'autre restant en surface ou en profondeur. Il peut par exemple s'agir de larves planctoniques qui remontent la nuit, ou au contraire chez d'autres espèces d'adultes qui suivent le plancton qui est leur ressource alimentaire. Un prédateur d'espèces effectuant ces migrations verticales peut lui-même suivre les migrations de ses proies, ou simplement attendre qu'elles viennent à lui. Toutes ces stratégies semblent coexister dans la nature.