La synagogue de Mopsueste est un édifice de culte juif situé dans la ville antique de Mopsueste (l'actuelle Misis, Yakapinar depuis les années 1960), en Turquie), en Cilicie. Son caractère juif est disputé et certains archéologues et historiens estiment qu'il s'agit en réalité d'une église chrétienne.