Balai Yasa Manggarai atau biasa disingkat menjadi BY MRI, adalah sebuah balai yasa milik Kereta Api Indonesia yang terletak di Manggarai, Tebet, Jakarta Selatan. Balai yasa seluas 2.000 meter × 500 meter ini terutama difungsikan untuk melakukan perawatan 24 bulanan (P24) dan perawatan 48 bulanan (P48) terhadap kereta milik Daerah Operasi I Jakarta hingga Daerah Operasi V Purwokerto serta KRL milik KAI Commuter yang dioperasikan di Daerah Operasi I Jakarta. Balai yasa ini juga dapat melakukan retrofit terhadap kereta.
Perawatan kereta di balai yasa ini dilakukan oleh sekitar 600 orang pekerja setiap harinya, dengan biaya Rp 60-150 juta per kereta. Perawatan kereta di balai yasa ini terdiri dari pengecekan bodi dan bogie, pelaksanaan perbaikan, pengukuran kesetimbangan, dan uji coba di lintas Manggarai-Cikampek.[1]