La colonna cromatografica è lo strumento principale usato nella tecnica della cromatografia. Si compone di due parti fondamentali: il supporto e l'impaccamento. Il supporto consiste fondamentalmente nella colonna stessa, intesa in senso fisico ovvero il cilindro (come nel caso dell'HPLC) dove viene fatto scorrere l'analita. Per impaccamento si intende invece la matrice inserita all'interno della colonna, una sostanza (ad esempio silice oppure polistirene) che permette di separare i composti iniettati. Un esempio di colonna è la cosiddetta "C-18", una colonna cromatografica largamente usata, il cui nome deriva dalla natura dell'impaccamento usato, una molecola costituita da 18 atomi di carbonio.