Domenico Benivieni (Firenze, 1460 circa – 1507) è stato un religioso italiano.
Paolo Benivieni era suo padre, Girolamo e Antonio suoi fratelli.
Era noto come cultore di testi aristotelici, logica e di teologia, lodato anche da Marsilio Ficino. Dal 1479 al 1481 fu lettore di logica nello studio pisano. Divenne poi spedalingo all'ospedale di Pescia.
Dal 1492 diventò uno dei principali difensori di Girolamo Savonarola e della sua opera purificatrice. Dal 16 febbraio 1498 gli fu vietato di assistere alle prediche di Savonarola e non fu più dispensato dalla partecipazione al coro della sua basilica, da cui fu poi sospeso.