Franz Schweigger-Seidel (Halle, 24 settembre 1834 – 23 agosto 1871) è stato un fisiologo tedesco.
Era il figlio del chimico Franz Wilhelm Schweigger-Seidel (1795-1838).
Nel 1858 conseguì il dottorato all'Università di Halle con una tesi dal titolo "Disquisitiones de callo". In seguito servì come assistente di Rudolf Heidenhain (1834-1897 presso l'istituto fisiologico di Breslavia, e dal 1865 fu assistente di Carl Ludwig (1816-1895) all'Università di Lipsia. Nel 1866 ricevette la sua abilitazione e durante l'anno seguente divenne professore associato a Lipsia.