Le guerre eugenetiche sono una serie di conflitti immaginari dell'universo di Star Trek. Sono avvenuti sulla Terra dal 1992 al 1996 e devastarono molte parti del globo.
Le guerre eugenetiche sono citate principalmente negli episodi Spazio profondo (Space Seed, 1967) della serie classica e la trilogia Terra di confine (Borderland), Stazione 12 (Cold Station 12) e I potenziati (The Augments), della serie televisiva Star Trek: Enterprise (2004). A Khan Noonien Singh e alle Guerre Eugenetiche, è inoltre dedicata la trilogia scritta da Greg Cox Star Trek: The Eugenics Wars, pubblicata da Pocket Books tra il 2002 e il 2006.