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Hieronymus David Gaubius (Heidelberg, 1705 – 29 novembre 1780) è stato un medico e chimico tedesco.
Studiò medicina e scienze presso l'Università di Harderwijk e di Leiden dove è stato allievo di Hermann Boerhaave (1668-1738) e Bernhard Siegfried Albinus (1697-1770). Ha conseguito la laurea a Leida nel 1725 con una tesi sulla medicina psicosomatica intitolata Dissertatio, qua idea generalis solidarum humani corporis partiur exhibitur. Dopo la laurea ha continuato la sua formazione a Parigi per poi praticare l'attività di medico ad Amsterdam e Deventer.
Gaubius nel 1731 fu invitato a Leida da Boerhaave come professore di chimica e nel 1734 divenne professore ordinario di medicina e chimica.