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Johann Ernst Fabri (Oels, 16 luglio 1755 – Erlangen, 30 maggio 1825) è stato un geografo, statistico e storico tedesco.
Nacque a Oels, oggi Oleśnica, in Bassa Slesia.
Nel 1776 intraprese lo studio della teologia all'Università di Halle, ma il suo interesse presto lo condusse a studiare geografia e storia. Successivamente insegnò all'Università di Gottinga, dove fu influenzato da importanti studiosi come Johann Christoph Gatterer, August Ludwig von Schlözer e Johann Friedrich Blumenbach.
Nel 1786 si trasferì a Jena come professore associato di geografia e statistica e nel 1794 divenne professore all'Università di Erlangen. Per buona parte della sua carriera Fabri non ricevette alcun compenso per le sue lezioni, solo nel 1815 incominciò a ricevere uno stipendio fisso.