Jonathan Clarkson Gibbs, II (Filadelfia, 28 settembre 1821 – Tallahassee, 14 agosto 1874), è stato un pastore presbiteriano e un funzionario pubblico afroamericano. Ricoprì i ruoli di Primo Segretario di Stato e sovrintendente della Pubblica Istruzione della Florida e, insieme a Josiah Thomas Walls, è stato tra i neri titolari di incarichi statali più importanti durante il periodo della Ricostruzione negli Stati Uniti.