Jonathan Eybeschütz, in ebraico יהונתן אייבשיץ? (Cracovia, 1690 – Altona, 1764), è stato un rabbino polacco. Talmudista, halakhista e cabalista, fu dayan (giudice) di Praga e successivamente rabbino delle "tre comunità" (Altona, Amburgo e Wandsbek). Insieme a Jacob Emden fu protagonista della controversia Emden-Eybeschütz