In embriologia dei vertebrati il miotomo, detto anche segmento muscolare embrionale, è un gruppo di tessuti che costituiranno i muscoli. In precedenza il termine per indicare il miotomo era segmento o placca muscolare.
Il miotomo è quindi quella porzione del somite (a sua volta frazione del mesoderma) che, al termine del processo di gastrulazione, si troverà in posizione intermedia tra lo sclerotomo che darà origine al cranio posteriore ed alle vertebre, ed il dermatomo che si trasformerà, fra le altre cose, nel derma delle regioni dorsali e laterali del corpo.
Dal miotomo si ha la formazione di muscoli (cellule miogeniche). Il miotomo va ben presto incontro a segmentazione: questi nuovi miotomi metamerici si insinueranno tra il mesoderma della piastra laterale (che dà origine al peritoneo ed al mesentere) e l'ectoderma (che è il foglietto embrionale più esterno) dando così origine alla maggior parte della muscolatura somatica.