Bottelen is het vullen van flessen met een vloeistof.
Een (deel van een) fabriek waar men dranken zoals frisdrank, vruchtensappen, bier of wijn in flessen doet, wordt een bottelarij genoemd.
Na het reinigen van de flessen worden deze gevuld en vervolgens afgesloten met een kurk, kroonkurk, schroefdop of beugeldop. Afhankelijk van de inhoud van de fles, kan het geheel daarna nog gepasteuriseerd worden.