CRISPR | ||||
---|---|---|---|---|
Het CRISPR-eiwit Cas (blauw) gebonden aan enkelstrengs DNA (oranje)
| ||||
Identificatie | ||||
Organisme | Escherichia coli | |||
CRISPR | ||||
PDB-codes | 4QYZ | |||
Externe identificaties | ||||
UniProt | P38036 | |||
|
Crispr,[1] in wetenschappelijke publicaties gewoonlijk gespeld als CRISPR, is een afkorting van het Engelstalige begrip Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats. Het beschrijft een belangrijk onderdeel van het bacteriële verdedigingsmechanisme tegen virussen. CRISPR's zijn sequenties in het bacteriële DNA, die de bacterie gebruikt om een virusinfectie te herkennen en af te weren.[2] Samen met het enzym Cas9 vormen ze de basis voor de populaire CRISPR/Cas-technologie,[3] die gebruikt kan worden voor het gericht bewerken van het genoom van een organisme.[4]
CRISPR is te herkennen aan de korte herhalingen van telkens dezelfde reeks basen. Elke herhaling wordt gevolgd door korte stukjes spacer DNA, afkomstig van vorige blootstellingen aan virussen. Het CRISPR associated system, afgekort Cas, gebruikt CRISPR spacers op een vergelijkbare manier als RNA-interferentie bij eukaryoten. CRISPR’s komen voor bij – naar schatting – ongeveer 40% van de bacteriële genomen en bij 90% van de Archaea.[5]