Endochondrale ossificatie, ook wel endochondrale botvorming is het vormen van bot, ossificatie, vanuit kraakbeen, en vindt bijvoorbeeld in de epifysairschijven, groeischijven, plaats.
In de epifysairschijven zijn vier zones betrokken bij endochondrale ossificatie:
I. Zone van inactief kraakbeen (reservezone): In deze zone ligt inactief hyalien kraakbeen opgeslagen
II. Proliferatiezone: Hier delen de kraakbeencellen zich sterk
III. Kraakbeen ombouwzone: De talrijke kraakbeencellen gaan de kraakbeenmatrix grotendeels resorberen, hierdoor zwellen ze op en sterven ze af en vormen zo pilaartjes, die transversale septa worden genoemd.
IV. Openingszone (ossificatiezone): In deze zone hechten de bloedvaten zich aan de transversale septa, om daar vervolgens bot te vormen