Dit artikel bevat een lijst van vlaggen van Bosnische deelgebieden. Bosnië en Herzegovina bestaat uit twee entiteiten: de Federatie van Bosnië en Herzegovina en de Servische Republiek. Daarnaast heeft het land een federaal district (Brčko). De Servische Republiek heeft haar eigen vlag. De Federatie van Bosnië en Herzegovina had tot 2007 ook een eigen vlag, maar deze werd geschrapt conform een uitspraak van het Grondwettelijk Hof. De Federatie van Bosnië en Herzegovina bestaat uit tien kantons, die ook elk een eigen vlag hebben (twee kantons hebben dezelfde vlag; zie hieronder). De Servische Republiek bestaat uit zeven regio's; zij hebben geen eigen vlag. Brčko en de Federatie van Bosnië en Herzegovina gebruiken de nationale vlag van Bosnië en Herzegovina.