Oeganda nam deel aan de Olympische Zomerspelen 2016 in Rio de Janeiro, Brazilië. De selectie bestond uit 21 atleten, actief in drie verschillende olympische sporten. Het was de grootste olympische ploeg van Oeganda sinds de Olympische Zomerspelen 1988.
Atleet Stephen Kiprotich verdedigde op de marathon zijn in 2012 behaalde olympische titel, de enige medaille van Oeganda in de afgelopen vijf edities van de Spelen. Waar zijn landgeoot Munyo Solomon Mutai als achtste finishte, werd Kiprotich veertiende in de uitslag.