Als onderdeel van de organische chemie wordt in de organische structuurtheorie nagegaan welke rangschikkingen van atomen tot bestaanbare organische verbindingen kunnen voeren. Oorspronkelijk was de organische structuurtheorie vooral een hoeveelheid ervaringswijsheid. Met het besef dat bindingen een vaste lengte hebben en rond een koolstofatoom onder vaste hoeken ten opzichte van elkaar staan werd een eerste stap gezet naar een voorspellende theorie. Met de ontwikkeling van de kwantummechanica en de computationele chemie werd de voorspellende waarde van de theorie steeds groter.
Naast de voorspellende waarde heeft de theorie tegenwoordig ook een wetenschappelijk uitdagende waarde.