Back بنك بيانات البروتينات Arabic Protein Data Bank Bulgarian Proteinska banka podataka BS Protein Data Bank Catalan Protein Data Bank Czech Protein Data Bank Danish Protein Data Bank German Βάση δεδομένων πρωτεϊνών Greek Protein Data Bank English Proteina Datenbazo Esperanto
| Protein Data Bank | ||||
|---|---|---|---|---|
| ||||
| Type | databank | |||
| Taal | Engels | |||
| Registratie | optioneel | |||
| Eigenaar | Worldwide Protein Data Bank | |||
| Status | actief | |||
| Link | Officiële website | |||
| ||||
De Protein Data Bank (PDB) is een vrij toegankelijke databank met gegevens van grote biomoleculen zoals eiwitten en nucleïnezuren. De PDB wordt beheerd door de organisatie Worldwide Protein Data Bank (wwPDB). De gegevens in de databank zijn voornamelijk afkomstig van röntgendiffractie en NMR-spectroscopie door wetenschappers over de hele wereld.[1]
De PDB is een belangrijke bron voor onder meer de verschillende takken van de systeembiologie, zoals structurele genomica. De meeste belangrijke journals en organisaties, zoals de National Institutes of Health in de Verenigde Staten, eisen van wetenschappers dat ze hun structuurgegevens op de PDB plaatsen.
Andere databanken maken gebruik van de gegevens in de PDB om eiwitten te classificeren volgens bepaalde patronen. Zo verdelen bijvoorbeeld SCOP en CATH de structuren onder in groepen volgens het type structuur en de veronderstelde evolutionaire relaties; Gene Ontology categoriseert de structuren op basis van genen.[2]
- ↑ (en) wwPDB, Consortium (2019). Protein Data Bank: the single global archive for 3D macromolecular structure data. Nucleic Acids Res. 47 (D1): 520-528. PMID 30357364. PMC 6324056. DOI: 10.1093/nar/gky949.
- ↑ (en) Berman, H. M. (January 2008). The Protein Data Bank: a historical perspective. Acta Crystallographica Section A A64 (1): 88–95. PMID 18156675. DOI: 10.1107/S0108767307035623.