Een stobbenfrees is een freesmachine waarmee men de stobbe en wortels van een gerooide boom stuk kan maken, om te voorkomen dat deze opnieuw uitloopt.
Er bestaan vele soorten van klein tot zeer zwaar. Met een verticaal ronddraaiende schijf waarop beitels met een wolfraamcarbide punt bevestigd zijn wordt de stobbe tot een diepte van maximaal een meter versnipperd.