De vlag van Mijdrecht is op 17 mei 1963 bij raadsbesluit vastgesteld als gemeentevlag van de Utrechtse gemeente Mijdrecht. De vlag kan als volgt worden beschreven:
Drie banen van wit, rood en wit, met een hoogteverhouding van 1:4:1; Op de rode baan een Agnus Dei, staande op de onderste baan.
De kleuren en het ontwerp zijn ontleend aan het gemeentewapen.
Op 1 januari 1989 is Mijdrecht opgegaan in de gemeente De Ronde Venen. De vlag is daardoor als gemeentevlag komen te vervallen.