(1986-1991)
De vlag van Noordwoude is op 24 maart 1986 vastgesteld als de vlag van het waterschap Noordwoude. De vlag kan als volgt worden beschreven:
Twee even hoge banen van wit en zwart; over het midden een verticale gele baan, over een diagonale rode balk van broektop naar vluchtonder, elk van 1/4 vlaghoogte, met op de rode balk twee gele sterren en op de gele baan een rode ster.
Het ontwerp was van Hoge Raad van Adel. De kleuren en stukken zijn afgeleid van het wapen van het waterschap, terwijl de sterren zijn mutatis mutandis afkomstig uit het wapen van Hazerswoude.
Vanaf 1991 is de vlag niet langer als de vlag van deze waterschap in gebruik omdat het waterschap Noordwoude in het nieuwe waterschap Meer en Woude op is gegaan.