De vlag van Woerden is de gemeentelijke vlag van de Nederlandse gemeente Woerden. Deze vlag werd op 23 februari 2017 aangenomen na een gemeentelijke herindeling uit 2001 en verving een eerdere vlag uit 1989.[1] De vlag naar ontwerp van R. Alkemade, archivaris bij het RHC Rijnstreek en Lopikerwaard is aangemeld bij het nationale vlaggenregister van de Hoge Raad van Adel. De beschrijving luidt:
Drie banen in de verhouding 2:1:2, waarvan de bovenste en onderste baan van goud en de middelste baan geëchiquetteerd van lazuur en zilver in drie tires. In de broektop drie Andreaskruizen van keel, in de broekhoek een waldhoorn van keel en in de vluchthoek drie lozanjes van keel. Hoogte en lengte in verhouding van 2:3 conform de nationale vlag. [2]
De verschillen ten opzichte van de voorgaande vlag zijn de toevoeging van een historisch element van de voormalige gemeente Harmelen: drie rode ruiten. Tevens werd het enkele Andreaskruis dat naar het wapen van Kamerik verwees vervangen door drie kruizen.