Het wapen van Franeker is sinds 1984 officieel niet meer in gebruik, in dat jaar is de gemeente Franeker opgegaan in de gemeente Franekeradeel, wel is de klok opgenomen in het nieuwe gemeentewapen. Ook de schildhouder, de godin Ceres doet dienst als schildhouder in dat nieuwe gemeentelijke wapen. Zij wordt aldaar vergezeld van Minerva.
De klok in het wapen van Franeker staat voor de macht die de stad had buiten haar poorten. Bij het luiden van een speciale klok diende iedereen die zich buiten de poorten bevond naar binnen te komen. Het oudste stadszegel met daarop een klok stamt uit 1496, het tweede en tevens jongste zegel uit 1550. Het oudste bekende stadszegel van Franeker vertoont geen klok, maar een keizer zittende op een troon, hij heeft zijn rechterhand opgeheven. Rechts van de keizer nog twee personen met opgeheven handen.