Retrotranspozon

Retrotranspozon – typ transpozonu (transpozon RNA), stanowiący znaczną część genomów organizmów eukariotycznych. Wszystkie retrotranspozony występują w postaci cząsteczki RNA. Retrotranspozony zawierają geny kodujące enzymy niezbędne do przemieszczania się w procesie transpozycji - po wniknięciu do komórki gospodarza (lub po transkrypcji retrotranspozonu zintegrowanego z genomem gospodarza) następuje synteza pierwszej nici DNA przez enzym zwany odwrotną transkryptazą[1]. W ten sposób powstaje pozachromosomowa, dwuniciowa cząsteczka zbudowana z jednej nici RNA i jednej nici DNA. Następnie matrycowa nić RNA jest wytrawiana (przez enzym RNA-zę), a na jej miejsce syntetyzowana jest druga (komplementarna do pierwszej) nić DNA. Taki dwuniciowy DNA zostaje za pomocą enzymu integrazy wstawiony do genomu gospodarza[2].

Istnieją dwa typy retrotranspozonów[1]:

  • zawierające na obu końcach długie powtórzone sekwencje nukleotydów - LTR (z ang. Long Terminal Repeats);
  • nieposiadające sekwencji LTR - non-LTR.

Przykładem retrotranspozonów zawierających sekwencje LTR należą: retrowirusy (u zwierząt)[2], Ty1-copia oraz Ty3-gypsy[3]. Do retrotranspozonów niezawierających sekwencji LTR zalicza się elementy LINE oraz SINE[1].

  1. a b c Eugene M. McCarthy, John F. McDonald. Long terminal repeat retrotransposons of Mus musculus. „Genome Biology”. 5 (3), s. R14, 2004. PMID: 15003117. 
  2. a b Thomas H. Eickbush, Varuni K Jamburuthugoda. The diversity of retrotransposons and the properties of their reverse transcriptases. „Virus Research”. 134 (1-2), s. 221-234, 2008. DOI: 10.1016/j.virusres.2007.12.010. PMID: 18261821. 
  3. Amar Kumar, Jeffrey L. Bennetzen. Plant retrotransposons. „Annual Review of Genetics”. 33, s. 479-532, 1999. DOI: 10.1146/annurev.genet.33.1.479. PMID: 10690416. 

From Wikipedia, the free encyclopedia · View on Wikipedia

Developed by razib.in