Arqueobiologia, o estudo da biologia dos tempos antigos, através de materiais arqueológicos, é uma subespecialidade da arqueologia. Ela pode ser vista como um termo geral para paleobotânica, osteologia animal, zooarqueologia, microbiologia, e muitas outras sub-disciplinas. Especificamente, vegetais e restos de animais também são chamados de biofatos. Às vezes, esses biofatos podem ser deixados por seres humanos e, às vezes, eles podem ser de ocorrência natural. A arqueobiologia tende a concentrar-se nos mais recentes achados, assim, a diferença entre arqueobiologia e a paleontologia é principalmente um sistema de data: arqueobiólogos trabalham geralmente com as datas mais recente, material não fossilizado encontrado em sítios arqueológicos. Apenas muito raramente são escavações arqueobiológicas realizadas em locais sem sinal de presença humana.