Em 1520, El-Rei D. Manuel I ao pretender estipular uma divisão mais clara das funções de cada um dos Vedores da Fazenda refere-se a ele, ao Barão de Alvito e a D. Pedro de Castro, que se manterão em funções com D. João III.[1]
Ao largar o seu serviço na corte foi viver para Belém e depois para Évora, onde faleceu.
Jaz na capela-mor da Igreja de Nossa Senhora da Graça da mesma cidade[2]
Seu neto Henrique de Portugal imprimiu em 1603 um livro, acerca do avô, com o título «Sentenças de D. Francisco de Portugal, I. Conde de Vimioso»[3].