O Sistema de classificação APG II, sucessor do Sistema APG de 1998, foi um sistema para a classificação das angiospermas – segundo critérios filogenéticos -, publicado em 2003 por um vasto grupo de pesquisadores que se autodenominou "APG II" (do inglês Angiosperm Phylogeny Group, Grupo para a Filogenia das Angiospermas).[1]
Este sistema de classificação das angiospermas é marcadamente diferente dos anteriores, "tradicionais" e baseados em critérios morfológicos. O sistema ainda está em pleno desenvolvimento e evolução, sendo revisado constantemente, pois muitos nodos da filogenia são de conhecimento muito recente (por exemplo, que Amborella é uma angiosperma basal) e outros não apresentam ainda um posicionamento cladístico concreto.
Como particularidade, este sistema só engloba categorias taxonômicas desde as espécies até as ordens, e não caracteriza táxons acima da ordem. Os grupos considerados "categoricamente superiores" são denominados com nomes "informais" (não sujeitos ao Código Internacional de Nomenclatura Botânica), sendo mais apropriado denominá-los de clados em vez de "taxons".
Os grupos principais de clados (não táxons) são os seguintes: