GeneCards

GeneCards — база данных человеческих генов, что обеспечивает геномную, протеомную, транскриптомную, генетическую и функциональную информацию о всех известных и предсказанных генов человека^[1][2][3]. Она разрабатывается и поддерживается Коронным центром человеческого генома в Институте науки им. Вейцмана.

Эта база данных имеет целью дать краткий обзор имеющейся в настоящее время биомедицинской информации об искомых генов, включая гены человека, закодированных белков, и соответствующие заболевания^[1][4][5]. GeneCards предоставляет доступ к бесплатным веб-ресурсам о более чем 7000 всех известных человеческих генов, собранных из >90 ресурсов, таких как HGNC, Ensembl и NCBI. Ядро перечня генов основано на утвержденных генных символах опубликованных Комитетом по номенклатуре генов HUGO (HGNC)^[6][7]. Сведения тщательно собирались и отбирались из этих баз данных мощным и удобным движком. Если поиск не возвращает никаких результатов, эта база данных даст ряд предложений, чтобы помочь пользователям выполнить их поиск в зависимости от типа запроса, и предоставит прямые ссылки на поисковые системы других баз данных^[1]. Со временем GeneCards разработала набор инструментов (GeneDecks, GeneLoc, GeneALaCart), которые предоставляют более специализированные возможности. С 1998 года GeneCards база широко используется в биоинформатике, геномике и в медицинском сообществе^[6][7].

1. ↑ ^{1 2 3} Rebhan M., Chalifa-Caspi V., Prilusky J., Lancet D. GeneCards: integrating information about genes, proteins and diseases (англ.) // Trends Genet.^[англ.] : journal. — 1997. — April (vol. 13, no. 4). — P. 163. — doi:10.1016/S0168-9525(97)01103-7. — PMID 9097728.
2. ↑ Safran M., Solomon I., Shmueli O., Lapidot M., Shen-Orr S., Adato A., Ben-Dor U., Esterman N., Rosen N., Peter I., Olender T., Chalifa-Caspi V., Lancet D. GeneCards 2002: towards a complete, object-oriented, human gene compendium (англ.) // Bioinformatics : journal. — 2002. — November (vol. 18, no. 11). — P. 1542—1543. — doi:10.1093/bioinformatics/18.11.1542. — PMID 12424129.
3. ↑ Harel A., Inger A., Stelzer G., Strichman-Almashanu L., Dalah I., Safran M., Lancet D. GIFtS: annotation landscape analysis with GeneCards (англ.) // BMC Bioinformatics^[англ.] : journal. — 2009. — October (vol. 10, no. 1). — P. 348. — doi:10.1186/1471-2105-10-348. — PMID 19852797. — PMC 2774327.
4. ↑ GeneCards (англ.). GeneCards. Дата обращения: 18 октября 2013. Архивировано 14 октября 2013 года.
5. ↑ GeneCards (англ.). Дата обращения: 19 октября 2013. Архивировано 17 августа 2018 года.
6. ↑ ^{1 2} Stelzer G., Dalah I., Iny Stein T., Satanower Y., Rosen N., Nativ N., Oz-Levi D., Olender T., Belinky F., Bahir I., Krug H., Perco P., Mayer B., Kolker E., Safran M and Lancet D. In-silico Human Genomics with GeneCards (англ.) // Human Genomics. — 2011. — October (vol. 5, no. 6). — P. 709—717. — doi:10.1186/1479-7364-5-6-709. — PMID 22155609. — PMC 3525253.
7. ↑ ^{1 2} Safran M., Dalah I., Alexander J., Rosen N., Iny Stein T., Shmoish M., Nativ N., Bahir I., Doniger T., Krug H., Sirota-Madi A., Olender T., Golan Y., Stelzer G., Harel A and Lancet D. GeneCards Version 3: the human gene integrator (англ.) // Database. — 2010. — Vol. 2010. — P. baq020. — doi:10.1093/database/baq020. — PMID 20689021. — PMC 2938269.