HDAC1

HDAC1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BKX, 5ICN
Ідентифікатори
Символи	HDAC1, GON-10, HD1, RPD3, RPD3L1, histone deacetylase 1, KDAC1
Зовнішні ІД	OMIM: 601241 MGI: 108086 HomoloGene: 68426 GeneCards: HDAC1
Реагує на сполуку
abexinostat, apicidin, belinostat, Масляна кислота, entinostat, givinostat, mocetinostat, panobinostat, pracinostat, quisinostat, resminostat, romidepsin, trichostatin A, Вальпроєва кислота, золінза, entinostat, cudc-101, cudc-907, tacedinaline[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • NAD-dependent histone deacetylase activity (H3-K14 specific) • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase activity • protein N-terminus binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein deacetylase activity • histone deacetylase binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • NF-kappaB binding • deacetylase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleosomal DNA binding • enzyme binding • hydrolase activity • core promoter sequence-specific DNA binding • p53 binding • transcription factor binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin binding • Krueppel-associated box domain binding • E-box binding • promoter-specific chromatin binding Клітинна компонента • цитоплазма • NuRD complex • гіалоплазма • histone deacetylase complex • Sin3 complex • нуклеоплазма • клітинне ядро • Хроматин • GO:0035328 Гетерохроматин • transcription regulator complex • transcription repressor complex • GO:0009327 protein-containing complex • neuronal cell body • Sin3-type complex Біологічний процес • hair follicle placode formation • epidermal cell differentiation • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • negative regulation of androgen receptor signaling pathway • embryonic digit morphogenesis • negative regulation of apoptotic process • зсідання крові • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • eyelid development in camera-type eye • circadian regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • odontogenesis of dentin-containing tooth • protein deacetylation • histone H4 deacetylation • fungiform papilla formation • negative regulation of myotube differentiation • GO:0022415 viral process • histone deacetylation • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of signal transduction by p53 class mediator • DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • beta-catenin-TCF complex assembly • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of cell population proliferation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone H3 deacetylation • regulation of megakaryocyte differentiation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • endoderm development • циркадний ритм • hippocampus development • neuron differentiation • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of oligodendrocyte differentiation • regulation of endopeptidase activity • regulation of amyloid-beta clearance • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3065	433759
Ensembl	ENSG00000116478	ENSMUSG00000028800
UniProt	Q13547	O09106
RefSeq (мРНК)	NM_004964	NM_008228
RefSeq (білок)	NP_004955	NP_032254
Локус (UCSC)	Хр. 1: 32.29 – 32.33 Mb	Хр. 4: 129.41 – 129.44 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HDAC1 (англ. Histone deacetylase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми^[4]. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 482 амінокислот, а молекулярна маса — 55 103^[5].

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, гідролаз, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Локалізований у ядрі.

1. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з histone deacetylase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. ↑ Human PubMed Reference:.
3. ↑ Mouse PubMed Reference:.
4. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4852 (англ.) . Архів оригіналу за 14 липня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.
5. ↑ UniProt, Q13547 (англ.) . Архів оригіналу за 12 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.